Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms