Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COG7P83436 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG7P83436 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG7P83436 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms