Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HK3P52790 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HK3P52790 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HK3P52790 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HK3P52790 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HK3P52790 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HK3P52790 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HK3P52790 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HK3P52790 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms