Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CASQ1P31415 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CASQ1P31415 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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CASQ1P31415 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CASQ1P31415 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CASQ1P31415 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CASQ1P31415 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CASQ1P31415 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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