Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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PTPRAP18433 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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PTPRAP18433 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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PTPRAP18433 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PTPRAP18433 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PTPRAP18433 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PTPRAP18433 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PTPRAP18433 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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