Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA4P13612 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms