Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms