Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TIMM17BO60830 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms