Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms