Protein–RNA interactions for Protein: A6NMZ2

SNTN, Sentan, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTNA6NMZ2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTNA6NMZ2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTNA6NMZ2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTNA6NMZ2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTNA6NMZ2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTNA6NMZ2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTNA6NMZ2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTNA6NMZ2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNTNA6NMZ2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTNA6NMZ2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTNA6NMZ2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTNA6NMZ2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTNA6NMZ2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms