Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RABGEF1Q9UJ41 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RABGEF1Q9UJ41 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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