Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms