Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RNF7Q9UBF6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF7Q9UBF6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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