Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOMER3Q9NSC5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms