Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECSITQ9BQ95 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms