Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDRT15Q96T59 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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