Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDAQ92838 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDAQ92838 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDAQ92838 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDAQ92838 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDAQ92838 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDAQ92838 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDAQ92838 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDAQ92838 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDAQ92838 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EDAQ92838 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms