Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms