Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA9

VANGL1, Vang-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL1Q8TAA9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VANGL1Q8TAA9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms