Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG2

C7orf57, Uncharacterized protein C7orf57, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf57Q8NEG2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C7orf57Q8NEG2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms