Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNDC2Q86VQ3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms