Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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COL5A1-AS1Q5SY13 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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