Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2B3Q16720 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
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