Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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