Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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