Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CDH18Q13634 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDH18Q13634 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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