Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms