Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms