Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms