Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms