Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms