Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms