Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPAP49450 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPAP49450 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPAP49450 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPAP49450 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPAP49450 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPAP49450 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPAP49450 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPAP49450 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPAP49450 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPAP49450 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPAP49450 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms