Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms