Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PLNP26678 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PLNP26678 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PLNP26678 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PLNP26678 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PLNP26678 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PLNP26678 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms