Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms