Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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