Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DENRO43583 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DENRO43583 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DENRO43583 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms