Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms