Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF839A8K0R7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms