Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms