Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNA3Q9UI47 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms