Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THUMPD1Q9NXG2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms