Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NRIP3Q9NQ35 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NRIP3Q9NQ35 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NRIP3Q9NQ35 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NRIP3Q9NQ35 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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