Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms