Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms