Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms