Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPRD1AQ96P16 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms