Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms