Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms